依據(jù)上述文件，2017年研發(fā)費用加計扣除申請的流程和準備的材料如下：

1、申報流程（2017年）

2、申報資料

雖然從條文中只有備案資料需提交稅局，但第一部分已明確“優(yōu)惠事項備案表”應當同“歸集表”中各項數(shù)據(jù)保持一致，因此無論是備案資料，還是備查資料，企業(yè)均應當認真準備。

1、費用化與資本化的選擇

實例：核查中，大量企業(yè)持續(xù)多年享受研發(fā)費用稅前加計扣除政策優(yōu)惠，但研發(fā)支出在發(fā)生當期均全部計入期間損益，作費用化處理。

核查重點：企業(yè)持續(xù)申報加計扣除，研發(fā)活動管理應當較為成熟，研發(fā)的最終結果應當具有一定的可預見性，對于形成研發(fā)成果的項目，應當有研究階段和開發(fā)階段的區(qū)分，并對開發(fā)階段發(fā)生的研發(fā)支出計入資本化。若企業(yè)研發(fā)已形成專利或著作權，原則上企業(yè)應確認無形資產，未確認的要說明未資本化原因。

華稅建議：1、部門共商，確認是否需資本化，并結合實際完善備查資料。加計扣除政策需要財務部門和研發(fā)部門共同協(xié)作，研發(fā)部門對于研發(fā)成果的價值合理衡量，共商財務部門評估是否滿足資本化的確認條件，合理確認。當然，即使形成無形資產，但不能同時滿足《企業(yè)會計準則第6號—無形資產》中需資本化的條件，企業(yè)在項目留存?zhèn)洳橘Y料中準備相應的說明文件，經過公司研發(fā)、財務等主管部門的審核，留存?zhèn)洳椤?、注重會計科目設置的嚴謹性。設置成本類一級科目“研發(fā)支出”，二級明細設置“資本化支出和費用化支出”，“研發(fā)支出-資本化支出”核算進入開發(fā)階段很有可能形成無形資產的部分，滿足無形資產確認條件時，結轉至“無形資產”，按照無形資產成本的150%在稅前攤銷；“研發(fā)支出-費用化支出”核算費用化支出的部分，按月把“研發(fā)支出-費用化支出”結轉至“管理費用”，在按規(guī)定據(jù)實扣除的基礎上，按照本年度實際發(fā)生額的50%，從本年度應納稅所得額中扣除。

2、各項研發(fā)費用的計提比例需謹慎

實例：甲企業(yè)研發(fā)費用歸集如下（單位：萬元）：

核查重點：該企業(yè)材料費占比較高且在各個項目中平均分配，在2016年加計扣除檢查工作中，主管稅務機關要求企業(yè)提供直接投入的明細賬，并進一步說明：1、耗用原材料的名稱；2、有在回收利用價值或產生廢料收入的是否沖減研發(fā)費；3、研發(fā)用于生產用如何劃分，劃分依據(jù)是什么，若按照工時劃分能否提供原始的工時記錄單等。

華稅建議：1、結合所屬技術領域、依據(jù)研發(fā)實際合理確定各項研發(fā)費用比例。稅務機關在檢查中，根據(jù)企業(yè)關鍵技術領域，對于企業(yè)可歸集研發(fā)費用范圍會形成初步判斷。例如：甲企業(yè)屬于新材料領域，進行研發(fā)時確實會存在相較于其他企業(yè)（如軟件類企業(yè)）更多的直接投入費用，但比例畸高會直接受到稅局的質疑。因此企業(yè)應當結合自身所屬技術領域，對于研發(fā)費用占比較高的部分尤其注意。2、注重輔助賬的建立及研發(fā)使用情況記錄的保留。結合甲企業(yè)，應當有領料單（如下圖）作為直投費用發(fā)生的依據(jù)，留待稅務機關檢查。

3、研發(fā)費用計提的證明材料需留存

核查重點：1、項目人員數(shù)量較多，根據(jù)項目人員編制情況中，人員在項目中職責，如“系統(tǒng)測試”“前期調研”“樣品鑒定”等，通過職責表述，該部分人員應當參與了項目的部分研發(fā)工作，應當按照參與研發(fā)的實際工時，將參與項目期間的人員人工費用計入；2、備案資料的研發(fā)人員名單與工資發(fā)放人員名單存在差異，要求企業(yè)提供說明；3、列入研發(fā)費的人員費用與生產如何劃分，原則是什么。工資畸高部分的研發(fā)人員以及項目管理人員，請?zhí)峁┕ぷ饔涗洝€人工作成果等證明材料。

華稅建議：1.注重研發(fā)人員日常工作記錄的留存。對研發(fā)人員在崗位中的職責嚴謹、全面表述。2.編制研發(fā)人員工時分配表。（1）若科技人員同期參與多個項目的研發(fā)，應當根據(jù)參與各個項目的工時編制工時分配表，將該研發(fā)人員的工資、薪金等按照實際參與項目的工時合理分配，并留存工時分配表備查。（2）若科技人員并非專門從事研發(fā)的人員，同時承擔生產或其他崗位工作，或某項目研發(fā)周期較短，應當編制工時分配表，根據(jù)該科技人員每月實際從事研發(fā)的時間按月匯總，從而合理歸集該部分人員人工費用。

特別需要提示的是，按照新規(guī)，稅務機關應加強對享受研發(fā)費用加計扣除優(yōu)惠企業(yè)的后續(xù)管理和監(jiān)督檢查。每年匯算清繳期結束后應開展檢查，核查面不得低于享受該優(yōu)惠企業(yè)戶數(shù)的20%。企業(yè)應高度重視備查資料的嚴謹性和完備性。