最近，國務院辦公廳印發(fā)《關(guān)于促進社會辦醫(yī)加快發(fā)展若干政策措施的通知》（國辦發(fā)〔2015〕45號），要求落實醫(yī)療機構(gòu)稅收政策，鼓勵和引導社會資本舉辦醫(yī)療機構(gòu)。目前，我國公立醫(yī)療機構(gòu)都是非營利性，非公立醫(yī)療機構(gòu)即社會資本所辦醫(yī)療機構(gòu)包括營利性和非營利性兩類，相應的稅收政策適用也應有所區(qū)分。

共性

●營業(yè)稅

營業(yè)稅暫行條例第八條第（三）款規(guī)定，醫(yī)院、診所和其他醫(yī)療機構(gòu)提供的醫(yī)療服務免征營業(yè)稅。

提示：1.自2009年1月1日起，醫(yī)療機構(gòu)（包括營利性、非營利性的公立、民營、個體以及部隊醫(yī)療機構(gòu)）不再區(qū)分營利性和非營利性醫(yī)療機構(gòu)，對其取得的醫(yī)療服務收入均免征營業(yè)稅，不受價格期限的限制。

2.對非營利性醫(yī)療機構(gòu)從事非醫(yī)療服務取得的收入，如租賃收入、財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收入、培訓收入、對外投資收入等應按規(guī)定征收各項稅收。

●個人所得稅

《財政部、國家稅務總局關(guān)于醫(yī)療機構(gòu)有關(guān)個人所得稅政策問題的通知》（財稅〔2003〕109號）規(guī)定，《財政部、國家稅務總局關(guān)于醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)有關(guān)稅收政策的通知》（財稅〔2000〕42號）規(guī)定的對非營利的醫(yī)療機構(gòu)按照國家規(guī)定的價格取得的醫(yī)療服務收入免征各項稅收，僅指機構(gòu)自身的各項稅收，不包括個人從醫(yī)療機構(gòu)取得所得應納的個人所得稅。按照個人所得稅法的規(guī)定，個人取得應稅所得，應依法繳納個人所得稅。個人因在醫(yī)療機構(gòu)（包括營利性醫(yī)療機構(gòu)和非營利性醫(yī)療機構(gòu)）任職而取得的所得，依據(jù)個人所得稅法的規(guī)定，應按照“工資、薪金所得”應稅項目計征個人所得稅。

●稅務登記

無論營利性與非營利性醫(yī)療機構(gòu)均應依法辦理稅務登記。國辦發(fā)〔2015〕45號文件規(guī)定，社會資本可按照經(jīng)營目的，自主申辦營利性或非營利性醫(yī)療機構(gòu)。衛(wèi)生、民政、工商、稅務等相關(guān)部門要依法登記，分類管理。

稅收征管法實施細則第十二條規(guī)定，從事生產(chǎn)、經(jīng)營的納稅人應當自領(lǐng)取營業(yè)執(zhí)照之日起30日內(nèi)，向生產(chǎn)、經(jīng)營地或者納稅義務發(fā)生地的主管稅務機關(guān)申報辦理稅務登記，如實填寫稅務登記表，并按照稅務機關(guān)的要求提供有關(guān)證件、資料。前款規(guī)定以外的納稅人，除國家機關(guān)和個人外，應當自納稅義務發(fā)生之日起30日內(nèi)，持有關(guān)證件向所在地的主管稅務機關(guān)申報辦理稅務登記。

發(fā)票管理辦法第十五條規(guī)定，需要領(lǐng)購發(fā)票的單位和個人，應當持稅務登記證件、經(jīng)辦人身份證明、按照國務院稅務主管部門規(guī)定式樣制作的發(fā)票專用章的印模，向主管稅務機關(guān)辦理發(fā)票領(lǐng)購手續(xù)。

稅收征管法實施細則第十八條規(guī)定，除按照規(guī)定不需要發(fā)給稅務登記證件的外，納稅人辦理包括申請減稅、免稅、退稅和領(lǐng)購發(fā)票等事項時，必須持稅務登記證件。

稅務登記管理辦法第九條規(guī)定，納稅人辦理開立銀行賬戶和領(lǐng)購發(fā)票事項時，必須提供稅務登記證件，納稅人辦理其他稅務事項時，應當出示稅務登記證件，經(jīng)稅務機關(guān)核準相關(guān)信息后辦理手續(xù)。

差異

●優(yōu)惠規(guī)定

1.非營利性醫(yī)療機構(gòu)

增值稅：對非營利性醫(yī)療機構(gòu)自產(chǎn)自用的制劑，免征增值稅；非營利性醫(yī)療機構(gòu)的藥房分離為獨立的藥品零售企業(yè)，應按規(guī)定征收各項稅收。

房產(chǎn)稅、土地使用稅、車船使用稅：對符合規(guī)定的社會辦非營利性醫(yī)療機構(gòu)自用的房產(chǎn)、土地、車船，免征房產(chǎn)稅、城鎮(zhèn)土地使用稅和車船使用稅。

企業(yè)所得稅：社會辦醫(yī)療機構(gòu)按照企業(yè)所得稅法規(guī)定，經(jīng)認定為非營利組織的，對其提供的醫(yī)療服務等符合條件的收入免征企業(yè)所得稅；企業(yè)、個人通過公益性社會團體或者縣級以上人民政府及其部門對社會辦非營利性醫(yī)療機構(gòu)的捐贈，按照稅法規(guī)定予以稅前扣除。